Santa Clara, es un municipio que todavía reserva a los investigadores numerosas sorpresas, pues guarda en sus entrañas misterios geológicos que permitirán a las generaciones futuras elaborar la historia de la tierra en esta zona, con los restos paleontológicos que por ahora asombran la curiosidad de unos cuantos.

Gigantescos animales y una composición química particular en sedimentos y lavas, son por ahora los descubrimientos que destacan en un área que presenta gran antigüedad, y que de alguna manera recoge también los restos de asentamientos humanos cuya edad no ha sido determinada

Del tiempo moderno, se tiene la certeza de que tepehuanos, zacatecos y laguneros tenían encuentros en su territorio de diferente matiz, pues algunas veces eran pacíficos, pero también ocurrieron enfrentamientos que obligaban a replegarse a las tribus norteñas, pues la habilidad guerrera de los chichimecas del sur, nadie la ha cuestionado hasta ahora.